1941 – 1945 гг. Великая Отечественная война – 570 «исхинцев» ушли на фронт.

         1941 г. 3 июля. Первыми были мобилизованы на фронт 106 студентов и 14 преподавателей во главе с директором института И.Е. Макаровым.

         1941 г. Декабрь. В Иркутск из Таганрога был эвакуирован институт механизации сельского хозяйства. Прибыли 30 студентов, 10 преподавателей, в том числе будущий директор ИСХИ – Г.И. Назаров.

         С 1 марта 1942 г. по 1 октября 1945 г. в главном корпусе института (ул. Тимирязева № 59) размещался военный госпиталь № 3908.

         1944 г. Март. Верховный главнокомандующий И.В. Сталин выразил благодарность сотрудникам и студентам ИСХИ, которые собрали и внесли в фонд обороны 22 тыс. 164 рубля наличными и 12775 рублей облигациями государственных займов.

         1972 г. 7-го мая открыт памятник–обелиск погибшим в годы Великой Отечественной войны преподавателям и студентам. На нём золотыми буквами высечены имена многих из тех, кто героически пал в боях за Родину, навсегда оставшись в сердцах благодарных потомков, исхинцев, свято почитающих своих боевых предшественников: комбата А. Герасимова, ротного А. Ануфриева, взводного И. Донского, полкового инженера П. Завьялова и многих других.

         1975 г. Май. Открыт «Музей боевой и трудовой славы» института.