Кафедра информатики и математического моделирования организована первого сентября 1969 г. как кафедра вычислительной техники и математического моделирования в составе экономического факультета.

В 1971 г. кафедра переименована в кафедру экономической кибернетики ввиду изменения программы и введения новых дисциплин.

В 2001 г. изменилось название кафедры в соответствии с преподаваемыми дисциплинами - «Информатика и математическое моделирование».

За период существования руководство кафедрой осуществляли:

Иштванов В.А., доцент - 09.1969- 09.1972 гг.

Кривошеин А.К., доцент - 10.1972 -12 1982 гг.

Елохин В.Р., доцент - 01.1983 - 08.1985 гг.

Лутин Я.А., доцент - 11.1986- 01.1992 гг.

Пивник Л.В., cт. преподаватель - 02.1992-03.1993 гг.

Булатов В.П., профессор - 03.1993 - 11.2001 гг.

Иваньо Я.М., профессор - 11.2001 - 01.2012 гг.;

Барсукова М.Н., доцент - 01.2012 - 11.2013 гг.

Петров Ю.И., доцент - 11.2013 - 08.2016 гг.

Иваньо Я.М., профессор  - 1.09.2016 – 06.2017;

Барсукова М.Н., доцент – 06.2017 – 09.2021;

Бендик Н.В., доцент – 09.2021 – 12.2024;

Полковская М.Н., доцент –  01.2025 – по настоящее время.

В 70-е и 80-е годы XX в. на кафедре под руководством Кривошеина А.К. выполнялись хоздоговорные темы по моделированию сельскохозяйственного производства: оптимизация машинно-тракторного парка.

С 1993 г. кафедру возглавил профессор В.П. Булатов. За период его заведования повысилась квалификация кадров. Профессором Булатовым В.П. создана научная школа по оптимизационным методам и их приложению в сельском хозяйстве.

В 2001 г. при участии кафедры открыта специальность «Прикладная информатика (в экономике) для подготовки специалистов информатиков-экономистов (бакалавров).

В 2008 г. на базе кафедры создана лаборатория информационных технологий и систем.

В 2009 г. открыта специальность 05.13.18 Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ по подготовке аспирантов

В 2010 г. произошел переход на двухуровневую систему образования. Кафедра является ведущей в подготовке бакалавров и магистров по направлению «Прикладная информатика».

В 2012 г. профессору Иваньо Я.М. решением Президиума Российской Академии Естествознания присвоено почетное звание основатель научной школы «Экономико-математическое моделирование сельскохозяйственного производства в условиях неполной информации».

В 2012 г. открыто новое направление бакалавриата  «Бизнес-информатика», профиль «Электронный бизнес».

В 2013 г. решением Президиума Российской Академии Естествознания (от 8.02.2013 г.) кафедра «Информатики и математического моделирования» награждена дипломом «Золотая кафедра России» серии «Золотой фонд отечественной науки».

В 2014 г. создан «Региональный центр прогнозирования развития АПК».

В 2020 г. создана Региональная инновационная площадка подготовки кадров высшего образования (бакалавриат, магистратура, аспирантура) для цифровой трансформации сельского хозяйства Иркутской области.