Одна из старейших в Университете, образована как кафедра Организации сельскохозяйственного производства в 1947 году. Сначала на этой кафедре велись все экономические дисциплины. В 1965-1966 гг. из нее выделились 4 кафедры, на базе которых был организован экономический факультет. Позже из состава выделилась кафедра управления, маркетинга и права. Однако в 2005 году она вновь присоединилась, а кафедра получила название «Организации и управления на предприятиях АПК». В 2012 году реорганизована в Кафедру менеджмента, предпринимательства и права с присоединением к кафедральным дисциплинам правовых дисциплин.

В 2015 году кафедра переименована в кафедру менеджмента, предпринимательства и экономической безопасности в АПК. В 2022 году кафедра получила название Экономической безопасности и предпринимательства.

Более 30 лет кафедру возглавлял первый декан факультета профессор Казанский А.М., которым была создана научная школа аграриев-экономистов Сибири. Под его руководством 31 человек защитили докторские и кандидатские диссертации. Многие его ученики работают на факультете.

На кафедре долгое время работали профессор Шерстобоев В.Н., доценты Пудеев И.А. (декан), Федоров П.П. (проректор), Вильчинский М.Е. (проректор, начальник областного сельскохозяйственного управления), Гуничев Н.П. (ректор), Борвенко Е.П. (декан экономического факультета), Уваров Ю.М. (декан экономического факультета), Рысьмятов З.А. (директор совхоза «Уковский»), Качалова С.В., Чаплиева Т.И., Токарева Э.А., Витиорец В.С., Верницкая А.Н. (директор областного ИКЦ для сельских товаропроизводителей), Федорова Т.П., Кузьмин В.В., Привалихин Н.Н., Ганина Н.А., Сухих Н.Г., Третьякова Г.Ф.

С 2005 по 2015 годы кафедру возглавлял д.э.н., профессор, Почетный экономист России Кириленко Александр Степанович, выпускник данной кафедры (1981 год), бывший министр сельского хозяйства Иркутской области.

В настоящее время с 2015 года заведующей кафедрой является к.э.н., доцент Попова Ирина Владимировна.